Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Limd1Q9QXD8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Limd1Q9QXD8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Limd1Q9QXD8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms