Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim44Q9QXA7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim44Q9QXA7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim44Q9QXA7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim44Q9QXA7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms