Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ap3m1Q9JKC8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms