Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ccl28Q9JIL2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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