Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nup50Q9JIH2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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