Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim39Q9ESN2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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