Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms