Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smco2Q9DA21 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms