Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Borcs8Q9D6Y4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Borcs8Q9D6Y4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Borcs8Q9D6Y4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms