Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc130Q9D516 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms