Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Obox1Q9D350 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms