Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms