Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Mrpl28Q9D1B9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl28Q9D1B9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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