Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hddc3Q9D114 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hddc3Q9D114 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms