Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed3Q9D0L1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms