Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Shmt2Q9CZN7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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