Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SdhdQ9CXV1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms