Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms