Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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