Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pfdn1Q9CWM4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pfdn1Q9CWM4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pfdn1Q9CWM4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pfdn1Q9CWM4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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