Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snw1Q9CSN1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms