Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS2

Nop10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop10Q9CQS2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nop10Q9CQS2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nop10Q9CQS2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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