Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nicn1Q9CQM0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms