Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl11Q9CQF0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms