Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms