Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg3Q9CPX6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms