Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms