Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spdl1Q923A2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms