Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms