Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Creb3l3Q91XE9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms