Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sh3bgrl3Q91VW3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms