Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms