Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim29Q8R2Q0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms