Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CipcQ8R0W1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms