Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf183Q8QZS5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf183Q8QZS5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf183Q8QZS5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf183Q8QZS5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf183Q8QZS5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf183Q8QZS5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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