Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms