Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MyripQ8K3I4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms