Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssh3Q8K330 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms