Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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