Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ercc8Q8CFD5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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