Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms