Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc187Q8C5V8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc187Q8C5V8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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