Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx16Q8C080 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms