Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ift57Q8BXG3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ift57Q8BXG3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms