Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6kb1Q8BSK8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6kb1Q8BSK8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6kb1Q8BSK8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms