Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gpc2Q8BKV1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gpc2Q8BKV1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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