Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms