Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cyp4f39Q8BGU0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cyp4f39Q8BGU0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms