Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim6Q8BGE7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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