Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnf187Q8BFX1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf187Q8BFX1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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